8月23日港珠澳大橋管理局通過官方微信發布消息稱，經廣東省人民政府批復同意，港珠澳大橋收費站車輛通行費收費標準確定為：小型客車（私家車、出租車）150元/車次；大型客車（過境巴士）200元/車次；穿梭巴士300元/車次；普通貨車60元/車次；貨櫃車115元/車次。收費標準以人民幣結算。

港珠澳大橋在靠近珠海和澳門一側設有一個收費站，所有上橋車輛均在此收費站繳費。收費站設有20條車道，車輛可通過ETC、香港快易通自動扣費，也可以使用支付寶、微信、人民幣現金支付。收費標準以人民幣為基準，港澳兩地按照扣費時的匯率實時換算。

目前大橋具體通車時間暫未公佈。由於三地交通規則不相同，在港珠澳大橋上實行內地的交通規則，靠右行駛；到達香港或澳門關口根據路線指引，轉換為靠左行駛。

目前可以通過繳費通行的車輛主要包括粵港兩地車牌車輛、港澳兩地車牌車輛、港籍單牌車輛（擁有澳門配額）、辦理一次性配額申請的車輛，以及粵港澳三地政府商議可經港珠澳大橋的其他車輛。

除了私家車外，亦可搭乘穿梭巴士往返大橋。今年3月28日，港珠澳大橋穿梭巴士有限公司正式揭牌。大橋通車後，該公司主要面向旅客提供來往港、珠、澳三地口岸的巴士出行服務，珠海口岸至香港口岸之間的單程巴士票價暫定為80元港幣。